Fue uno de los primeros templos construidos por la disposición de la corona española en territorio peruano. Es importante indicar que, en reconocimiento a la expulsión de los moros del territorio cristiano español, el papa inocencia VII, concesiono el rey Fernando ciertos privilegios, en lo referente a la administración de la iglesia dentro de su territorio y en sus colonias del nuevo mundo, prerrogativa que le sirvió para ordenar la construcción de templos en toda américa española.

Este recinto religioso, fue construido en la época de la fundación de la villa de san francisco de asís de maras que ocurrió en el año de 1556. Su importancia radica en que el templo fue edificado en un lugar donde se efectuaba intenso intercambio comercial, que se prolongó durante la época del virreinato con ese mismo ímpetu.